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依據民法第32條、參照「交通部審查交通事務財團法人設立許可及監督要點」第27條及本部93年7月訂定「交通部主管空運類財團法人查核計畫」等規定，本部每年對財團法人中華民國台灣飛行安全基金會進行書面定期查核外，並視實際需要辦理實地查核，並同時上網公開查核報告。